Ποια είναι η δοκιμασία για τον κοροναϊό και γιατί διαρκεί τόσο πολύ για την ανάπτυξη των δοκιμών;


Απάντηση 1:

Η Vox έχει ένα καλό άρθρο σχετικά με το γιατί πήρε τόσο πολύ χρόνο για να αυξήσει τις δοκιμές στις ΗΠΑ, η οποία συνοψίζει αυτό που έχω δει στις ειδησεογραφικές αναφορές τους τελευταίους μήνες.

Η σκληρή προσπάθεια του CDC να δοκιμάσει τους Αμερικανούς για κοροναϊό, εξήγησε

Θα ήθελα να τονίσω αυτό που λέει το άρθρο, δηλαδή "

Οι ακριβείς έλεγχοι είναι κρίσιμοι για την παύση μιας εστίας

. "

Ακριβής

δοκιμές, όχι πολλά και πολλά και πολλές δοκιμές. Η δημιουργία δοκιμών για έναν νέο ιό μπορεί να είναι δύσκολη και θέλετε να είστε σίγουροι ότι το κάνετε σωστά, ώστε να έχετε τις σωστές απαντήσεις - όχι ψευδώς θετικά, ούτε ψευδώς αρνητικά. Σύμφωνα με το άρθρο Vox,

Οι πιο χρησιμοποιούμενες δοκιμές της Κίνας είχαν σχεδόν αρνητικές αρνητικές επιπτώσεις

. Και

όλες οι χώρες

έχουν πρόβλημα με το

θέματα ευαισθησίας / ειδικότητας

με δοκιμές με κορωναϊό.

(Το άρθρο λέει ότι οι αριθμοί σχετικά με τις δοκιμές στις ΗΠΑ έχουν αφαιρεθεί από την ιστοσελίδα του CDC. Αναρωτιέμαι ποιος θα μπορούσε να έχει δώσει εντολή ...)


Απάντηση 2:

Η δοκιμασία για έναν ιό όπως ο νέος κοροναϊός είναι μια δοκιμή αλυσωτής αντίδρασης πολυμεράσης (PCR). Μόλις προσδιοριστεί η αλληλουχία του γονιδιώματος ενός ιού, η οποία μπορεί να γίνει με ακρίβεια και αξιοπιστία μέσα σε λίγες ημέρες, η αλληλουχία μπορεί να ελεγχθεί έναντι άλλων παρόμοιων ιών για να προσδιοριστεί το τμήμα του γενετικού κώδικα που διαφέρει από οποιοδήποτε άλλο.

Στη συνέχεια, η διαδικασία PCR είναι η ίδια με οποιαδήποτε άλλη διαδικασία. δημιουργούνται δύο τμήματα συμπληρωματικού DNA (που ονομάζονται πριμοδότες) μήκους 20 ζευγών βάσεων που συγκρατούν την περιοχή ενδιαφέροντος. Αρκετά από αυτά για να ολοκληρωθούν 10.000 αντιδράσεις κοστίζουν περίπου € 12 και μπορούν να γίνουν πολύ γρήγορα. Τα άλλα συστατικά μιας αντίδρασης PCR είναι πρότυπο απόθεμα το οποίο πολλές εταιρείες βιοτεχνολογίας έχουν στο ραφιό (στην κατάψυξη). Αυτά είναι 1) ρυθμιστικό αντίδρασης, το οποίο είναι πολύ καθαρό νερό με προστιθέμενο άλας μαγνησίου για να παρέχει το κατάλληλο περιβάλλον για το ένζυμο αντιγραφής του DNA

Taq πολυμεράση,

2) το

Taq

3) τα τέσσερα δομικά στοιχεία του DNA, αδενίνη, θυμίνη, γουανίνη και κυτοσίνη (Α, Τ, G και C) και 4) χρωστική η οποία φθορίζει μόνο παρουσία διπλής έλικος ϋΝΑ σε ποσότητα. Ένα μείγμα αντίδρασης αυτών των συστατικών στις σωστές αναλογίες μπορεί να παρασκευαστεί χύμα και η παροχή με πιπέτα σε φρεάτια μιας πλαστικής πλάκας πολλαπλών πηγαδιών μπορεί να πραγματοποιηθεί από έναν τεχνικό του ανθρώπου (μια πλάκα 96 φρεατίων που παρέχει δοκιμές για 32 δείγματα σε τριπλούν μπορεί να πάρει 10 λεπτά) ή η ρύθμιση μπορεί να αυτοματοποιηθεί και να εκτελεστεί σε πλάκες 384 φρεατίων. αυτό είναι 128 δοκιμές εις τριπλούν. Τα δείγματα που πρόκειται να δοκιμαστούν στη συνέχεια προστίθενται και οι πλάκες σφραγίζονται με πλαστική μεμβράνη έτσι ώστε να μην εμφανίζεται μόλυνση από το πηγούνι στο πηγάδι.

Η πλάκα τοποθετείται στη συνέχεια σε θερμικό κυκλώνα. αυτή είναι μια συσκευή ελεγχόμενη από την θερμοκρασία (ένα μονωμένο κιβώτιο με δυνατότητες θέρμανσης και ψύξης) που είναι σε θέση να αλλάζουν ταχύτατα μέσα από ένα εύρος θερμοκρασιών. Ζεσταίνει τα δείγματα στους 98 βαθμούς Κελσίου για να διαχωριστούν οι δύο κλώνοι του DNA στο δείγμα, στη συνέχεια περίπου 55-60 μοίρες για τους εκκινητές να δεσμευτούν στα δύο τμήματα του DNA που έχουν σχεδιαστεί για να συμπληρώσουν και περίπου 70 μοίρες για το ένζυμο για τη συναρμολόγηση των As, Ts, Gs και Cs μεταξύ των δύο εκκινητών. Στη συνέχεια χρησιμοποιείται υπεριώδης ακτινοβολία για την ανίχνευση του φθορισμού της βαφής, εάν υπάρχει αρκετό DNA. Θα υπάρχει μόνο αρκετό DNA για ανίχνευση αυτού του τρόπου εάν το δείγμα που προστίθεται στο μείγμα αντίδρασης περιέχει τις μοναδικές αλληλουχίες που σχεδιάστηκαν για την πρόσδεση των εκκινητών. Ένας κύκλος αυτών των βημάτων διαρκεί περίπου δύο λεπτά και 30 κύκλοι είναι αρκετοί για να προσδιορίσουν εάν υπάρχει κάποιο ιικό ϋΝΑ στο δείγμα. Υπάρχει ένα αρχικό βήμα μετουσίωσης και ένα τελικό βήμα επέκτασης που προσθέτουν λίγα λεπτά σε κάθε διαδρομή, οπότε τα αποτελέσματα για όλες τις αντιδράσεις χρειάζονται περίπου μια ώρα και μισή για να παραχθούν.

Εάν η διαδικασία αυτή γίνεται από έναν τεχνικό του ανθρώπινου δυναμικού και όχι από ένα αυτοματοποιημένο σύστημα, η επόμενη πλάκα που μπορεί να εισέλθει στον θερμικό κυκλοποιητή μπορεί να είναι έτοιμη ενώ η πρώτη λειτουργεί. Αυτό σημαίνει ότι ένα μόνο άτομο που χρησιμοποιεί ένα ενιαίο δίσκο κυκλικής διατήρησης 96 φρεατίων θα μπορούσε να επεξεργαστεί δείγματα εις τριπλούν από 640 άτομα σε μία οκταώρητη μετατόπιση. φυσικά οι μεγάλες εταιρείες βιοτεχνολογίας έχουν αυτοματοποιημένα συστήματα που μπορούν να λειτουργήσουν με πολύ μεγαλύτερο αριθμό δειγμάτων σε δεδομένη χρονική στιγμή.

Εάν υπάρχει η βούληση να δοκιμάσετε όσο το δυνατόν γρηγορότερα άτομα όσο το δυνατό γρηγορότερα, υπάρχουν ήδη τα αντιδραστήρια και τα μέσα για να το κάνουν. Αυτό που βλέπουμε είναι η έλλειψη αυτής της θέλησης.

Επεξεργασία που προστέθηκε σε απάντηση στο καλό σημείο του Keith Robison: Έχετε δίκιο: Έχασα τη χρήση ενός «οικολογικού γονιδίου» για κάθε δείγμα χάριν συντομίας. Δεν πήγα ούτε στο βήμα της ανάστροφης μεταγραφής, και θα έπρεπε να το ανέφερα καθώς φυσικά προσθέτει στον συνολικό χρόνο που χρειάζεται για να πάρει αποτέλεσμα. Συμπεριλαμβάνει τη λήψη του δείγματος RNA απλού κλώνου από έναν ασθενή και την τοποθέτησή του σε μίγμα αντίδρασης που περιέχει το ένζυμο ανάστροφης μεταγραφάσης και τα απαραίτητα δομικά στοιχεία για να δημιουργηθεί συμπληρωματικό ϋΝΑ κατάλληλο για μεταγενέστερη PCR. αυτό μπορεί να γίνει ως το πρώτο βήμα της Αντίστροφης Μεταγραφής -PCR όπως επισημαίνετε.


Απάντηση 3:

Ο κύριος λόγος πηγάζει από μια κακή απόφαση προηγούμενης διοίκησης, η οποία επιβάλλει ότι όλες οι δοκιμές που έγιναν έπρεπε να γίνονται μέσω των εργαστηρίων της FDA, όχι εκτός εργαστηρίων όπως συνέβαινε προηγουμένως, γεγονός που δημιούργησε έλλειψη κιτ δοκιμών. Το Trump που απορρίπτει αυτή την καθοδήγηση και συναντήθηκε με όλους τους κορυφαίους εργαστηριακούς ερευνητές εργαστήριο ερευνών και τώρα εκατομμύρια των κιτ δοκιμών θα είναι διαθέσιμα είναι μια εβδομάδα ή έτσι. Συνεπώς, θα υπάρχουν κατάλληλα κιτ δοκιμών σε κάθε νοσοκομείο της χώρας.